Attraverso il forum ufficiale di Assassin's Creed: Brotherhood veniamo a conoscenza di un fastidioso bug che sta affliggendo alcuni utenti che stanno attualmente giocando al titolo di Ubisoft. Il bug riguarderebbe sia la versione Xbox 360 che quella PS3 e impedirebbe il prosieguo dell'avventura con la conseguenza di ricominciare la storia dall'inizio. In pratica andando avanti nel gioco vi è un sistema di spostamento veloce da una zona all'altra di Roma effettuabile tramite dei tunnel sotterranei e dove il titolo salva automaticamente.

Nella Sequenza 2, Memoria 4 se Ezio usa questa sorta di portali, una volta giunto a destinazione potrebbe capitare che muoia senza che voi possiate rimediare in qualche modo. Unica soluzione fino a quando Ubisoft non rilascerà una patch che risolva l'incomodo, è non usare il sistema dei tunnel fino al momento in cui Machiavelli non ve lo illustrerà all'interno della trama principale. Il problema, dopo la spiegazione di Machiavelli, non si presenterebbe.